ในศตวรรษที่ 21 โลกได้เข้าสู่ยุคแห่งความขัดแย้ง เมื่อการค้นพบพลังงานใหม่ที่ชื่อ เนคโตริเบียม ได้จุดชนวนสงครามระหว่าง พันธมิตรสนธิสัญญาเสรี และ สาธารณรัฐโซจีเลีย ที่ต้องการครอบครองพลังงานชนิดนี้เพื่อขยายอิทธิพลไปทั่วโลก แม้พันธมิตรจะเสียเปรียบในการสู้รบ แต่ก็ได้พัฒนาระบบการต่อสู้ที่ล้ำสมัยขึ้นมา นั่นคือ Coupling System ระบบที่อนุญาตให้นักบินสองคนประสานพลังในการควบคุมหุ่นรบได้อย่างสมบูรณ์แบบ
ในปี 2014 อาโอบะ นักเรียนมัธยมปลายธรรมดาคนหนึ่ง ได้พบกับเหตุการณ์ที่เปลี่ยนแปลงชีวิตเขาไปตลอดกาล เมื่อเขาถูกโจมตีโดยหุ่นยนต์ยักษ์ปริศนา และได้พบกับ ฮินะ เพื่อนร่วมชั้นที่ซ่อนความสามารถพิเศษเอาไว้ ฮินะได้พาอาโอบะข้ามมิติเวลาไปยังอนาคตในปี 2088 เพื่อให้เขาได้พบกับ ดิโอ ผู้ที่รอคอยเขาอยู่ด้วยเหตุผลบางอย่าง